本课程重点介绍微生物生态学的基本概念、理论与假说、以及研究主题与研究现状；微生物的经典分离培养、生理生化、分子生物学检测技术、以及环境微生物宏基因组生物信息学分析方法；微生物与植物、人、动物和环境的互作机制；微生物多样性和群落组成的分析模型；不同生态系统中微生物多样性的分布格局与维持机制，微生物种群与群落的动态演替规律；微生物对全球气候变化和外来植物入侵的响应与调节机制；微生物在生物地球化学循环、污染物降解以及污染环境修复的作用；微生物在生态系统的物质循环、多样性维持、演替过程、以及干扰或破坏生态系统的植被恢复与重建过程中的作用。本课程旨在使研究生掌握微生物生态学的基本原理与研究方法，以及微生物生态学的最新研究进展与重点发展领域，为从事微生物生态学研究打下基础。

微生物学、生态学、环境科学专业研究生

参考书： N. J. Dix, J. Webster. Fungal Ecology, Springer, 1995 L. L. Barton, D. E. Northup. Microbial Ecology, Wiley-Blackwell, 2011 医学微生态学，李兰娟主编，出版社:人民卫生出版社，2014

前言（3学时，教师：郭良栋）
			1、微生物生态学研究历史、研究主题和研究意义
				1.1微生物生态学发展简介
				1.2基本概念、理论与假说
				1.3微生物生存策略与环境适应性
				1.4微生物生态学研究现状与意义
第一部分：微生物检测技术与分析方法（3学时，教师：郭良栋）
			2、传统技术
				2.1分离培养方法
				2.2直接观测方法
			3、生理生化技术
				3.1 Biolog方法
				3.2 PLFA方法
				3.3麦角固醇方法
			4、分子生物学技术
				4.1 G+C含量测定方法
				4.2 DNA杂交方法
				4.2 DNA指纹图谱方法
				4.3 DNA克隆文库测序方法
				4.4 DNA高通量测序方法
				4.5宏基因组生物信息分析方法
			5、生态学统计分析模型
				5.1多样性统计分析方法
				5.2群落组成统计分析方法
第二部分：微生物驱动的生物地球化学循环（3学时，教师：戴欣）
			6、基本元素循环
			7、大量元素循环
			8、微量元素循环
			9、环境污染物的转化与降解
第三部分：水域微生物生态学（9学时，教师：戴欣）
		10、海洋生态系统
			10.1微生物种群与群落结构
			10.2微生物分布格局及维持机制
			10.3微生物耐受极端环境的机制
			10.4微生物生态功能
			11、内陆水系生态系统
				11.1微生物种群与群落结构
				11.2微生物分布格局及维持机制
				11.3富营养化与蓝藻水华发生机制
				11.4微生物耐受极端环境的机制
				11.5微生物生态功能
第四部分：人体与动物微生物生态学（9学时，教师：王琳淇）
		12、人体生态系统
			12.1共生微生物起源及协同进化
			12.2微生物宏基因组学研究进展
			12.3微生物与人体营养代谢关系
			12.4微生态调控人类健康生物学机制
			12.5微生态干预策略与应用前景
		13、动物生态系统
			13.1肠道微生物多样性及共生机制
			13.2微生物与昆虫社会性及昆虫灾害控制
			13.3微生物与寄主物种灭绝的风险评价
			13.4微生物-环境-宿主的三者互作关系
第五部分：陆地微生物生态学（9学时，教师：郭良栋）
14、植物生态系统
	14.1植物共生菌、内生菌、表生菌和寄生菌
	14.2微生物多样性分布格局及维持机制
	14.3微生物种群和群落结构演替
	14.4微生物在植物生态系统演替过程中的作用
			15、土壤生态系统
				15.1微生物种群和群落结构演替
				15.2微生物多样性分布格局及维持机制
				15.3微生物对污染土壤的修复作用
				15.4微生物在土壤中的物质循环作用
16、大气生态系统
	16.1微生物群落结构
	16.2微生物多样性分布格局
17、微生物生态网络
	17.1网络生物学的发展
	17.2微生物功能网络结构
	17.3菌根共生网络结构
第六部分：全球变化微生物生态学（2学时，教师：郭良栋）
		18、微生物与全球气候变化的关系
			18.1气候变化对微生物的影响
			18.2微生物对气候变化的调节功能
		19、微生物与外来入侵植物的关系
			19.1外来植物入侵对微生物群落及功能的影响
			19.2微生物对外来植物入侵的调节机制
		
考试（2学时）
教学方式： 90 % 课堂授课 + 10 % 研讨
考核方式：闭卷考试（90%）+ 考勤（10%）